化肥是补充树体营养的很好肥料。但它也有很多缺点，一是营养元素比较单一；二是使用方法稍有不当，容易产生肥害，伤害树体；三是肥效期短。这就要采取科学的方法巧施化肥。
分次施肥全年施化肥2～3次。第一次在春季果树萌芽前，此时果树消耗营养物质多，需及时追肥补充营养。第二次在6月上旬，此时果实处在第一次迅速膨大期，花芽又开始分化，根系生长也较快，吸收活动活跃，土壤容易出现脱肥现象，需及时追肥补充。第三次在9月上旬，此时中、晚熟品种果实处于最后一次膨大期，树体即将进入贮备营养时期，特别是“大年”树对肥料需求很大，需追肥补充。通过多次追肥，既可避免一次施肥过多造成肥害，也可解决肥效期短的弊端。
多沟深施施肥沟要多，避免肥料过于集中形成肥害。盛果期树每株开8～10条沟，初果期树每株开6～8条沟，幼树每株开4～6条沟，采取放射状排列，沟长35～50厘米、沟深20～25厘米。施肥沟不要离树太近，防止接触大根造成伤害，一般在树冠枝展下开沟为宜。
合理配比化肥大部分是单一营养元素，为解决果树对多种营养元素的需求，需要两种以上化肥混合使用，混合时应注意不同时期的树体对营养元素的需求不一，春季对氮、磷元素要求多，夏季对磷、钾元素要求多，混合时应注意因时选择不易起化学反应的肥料混合。要按氮（有效氮）、磷（五氧化二磷）、钾（氧化钾）1∶0.5∶1的比例混合。选用果树专用肥时，一定要选不含氯化铵成分的，否则，易产生肥害。