一、清除田园 对于三七等冬季地上部分枯黄的药用植物，冬季植株叶片变黄枯萎时，将离地面3厘米左右的地上部分茎叶剪去，收集已枯死的茎叶，铲除园内外杂草及病残体，全部集中园外烧毁，以清洁田园，并用1∶1∶200的波尔多液或用0.2～0.3波美度石硫合剂喷洒畦面，进行土壤全面消毒。发现有露根现象时要适当培土。另外，在11月份清园后，每亩施腐熟农家肥2000公斤于植株根部，保护芽苞安全越冬。幼苗出土前，修补遮阳棚，遮光度应调到60%左右，使园内阳光增加，对翌年三七的生长发育有促进作用。
二、培土壅蔸 对于黄连、黄芪、人参、西洋参等，冬季培土壅蔸能促进幼苗的生长发育，使其根茎生长，根系的深度相应增加，减轻或避免低温冻害对根系造成的伤害，避免冻坏芽苞，有利于植株生长。培土时，挖起畦沟内的土壤，捣成疏松碎土，均匀撒于畦上。
三、冬季修剪巴戟天、连翘、枸杞、栀子、金银花、玫瑰花、五倍子、花椒等多年生木质藤本或灌木，这些植物生长2～3年后，根的生长已进入旺盛期，为防止其茎叶徒长，可在每年的冬季，结合插条的准备，将已老化呈绿色的茎蔓从基部剪下，用作扦插繁殖的材料，以减少营养物质的消耗，同时促进营养物质向根部积累，从而达到安全越冬、提高产量的目的。一般修剪后都要进行中耕除草、施肥，以利于春季植株尽快恢复正常生长。
四、重施冬肥砂仁、贝母、黄芩、穿心莲等，入冬前，衰退老苗群应割去老苗和枯老匍匐茎，挖松空地，重施有机肥，加强田间管理，促苗生长，确保植株安全越冬。可在土壤封冻前，每亩施1500～2000公斤土杂肥于行间，这样不仅能提高地温，起防冻保暖作用，还能起到冬肥春用提高土壤肥力的作用。冬肥能够满足整个生长期植株对养分源源不断的需求，多数越冬药材植株均可重施土杂肥以保护药材安全越冬。如根系外露，还要用客土进行培土，为翌年稳产高产打下基础。
五、盖草绞股蓝等多年生蓄根性草质藤本植物，虽然较耐低温，在南方不进行保护地栽培也能安全越冬，但在北方由于干旱低温时间较长，地下茎易发生冻害而死亡。所以在秋季收获地上部分后，要在冬前浇1次水，用稻草、茅草等秸秆遮盖药材植株行间，这样既能保持地温相对稳定，又能避免寒风直接侵袭植株根部。对其他草本药材幼苗的防冻，应先覆盖一层草木灰，再用塑料薄膜扣棚保护。