明
洪武元年(1368年)春，朱元璋派湖广行省平章杨璟率师南征。三月。左丞周德兴克全州路。
同年，改全州路为全州府。同知章复编《农圃通谕》1卷，分发全府农户，教民耕种。
洪武四年(1371年)乡民在蕉江龙口开采铅矿。
洪武六年(1373年)知府章复率县民从黄沙河至界首的百里官道两旁，种植松树。嗣后绿荫蔽道，人称“章侯松”。
洪武九年(1376年)全州府降为州。隶湖广永州府。裁清湘县。
洪武二十七年(1394年)全、灌瑶民反抗明王朝压迫，举行武装起义。朱元璋诏广西都指挥使韩观，调湖广营兵进行镇压，杀瑶民1400余人。
同年八月，全州由原隶湖南永州府改隶广西桂林府。
成化八年(1472年)全州大饥。
成化年间(1465～1487年)全州训导吴伯璋(福建闽县人)编《全州志》。已佚。
正德九年(1514年)开封府尹顾璘谪知全州。在清湘书院废址重建书院，广纳士子，并亲授艺文。
嘉靖元年(1522年)五月，州属四都(今庙头、文桥、黄沙河全境及永岁部分区域)山崩水涌、坏田禾数百顷。
嘉靖四年(1525年)知州黄应开在州署右西坡建凤坡书院。
嘉靖六年(1527年)四月初七日，飞鸾桥再建骏工，上筑瓦屋48间，两头尽处各一门。费白银1260两。
嘉靖九年(1530年)督学黄佐在湘山之东侧建湘山书院。
嘉靖二十一年(1542年)全州大疫。
同年夏四月丁卯午刻有飞石陨柳山应泉池。
嘉靖二十七年(1548年)六月，州属四都山崩水涌，冲毁升乡民房，毁田400余亩。
嘉靖二十八年(1549年) 广西督学谢少南总纂《全州志》。计7纲、58目，共10万言。已佚。
嘉靖三十六年(1557年)大田村士人邓尚友捐资重修璜溪书院，次年兴工，于三十八年竣工。
嘉靖四十年(1561年)，在县署右西坡复建凤坡书院。
万历十四年(1586年)邑人舒宏志中丙戍科探花。
万历年间(1573～1619年)全州学正王大猷撰《全州志》共二册。已佚。
万历四十六年(1618年)八月至十月，每夜有巨星见东方，长丈余，有白气如匹练自北而南。
崇祯二年(1629年)二月初九日，湘山松花会，有84人冒充香客，焚城内贵绅之家而劫其财，兵民奋力追捕，生擒10余人。
崇祯十年(1637年)湖南临武、蓝山农民郭子奴，率矿工起义，次年率军数万围攻全州。明廷震惊，诏令粤西巡抚林贽率狼兵数千人至全州，义军败走。
同年四月初八日，地理学家、旅游家徐霞客，乘舟溯湘江抵黄沙埠，在境内游历15天。
清
顺治四年(1647年)十月，清兵攻陷全州，知州马鸣銮降清。
同年，十一月初一日，南明军郝永忠(郝摇旗)、卢鼎、赵印选、焦琏各部，在全州大败清军，收复全州。
顺治五年(1648年)二月，清恭顺王孔有德率兵攻占全州。五月，南明军复之。
顺治六年(1649年) 八月、十二月全州两度易手。清朝任命的首任全州知州李令闻(浙江籍)就职视事。七年九月清军又占全州。
顺治九年(1652年)六月，南明抗清将领李定国率部由湖南向广西进军，攻克全州，即围桂林，清定南王孔有德自杀。次年李军退出全州。
康熙十三年(1674年)四月，去岁平西王吴三桂反清，此时遣兵2万屯驻黄沙河。
康熙十七年(1678年)彗星见东方。
康熙十八年(1679年)五月，全州大饥，担米售银2两。
康熙二十七年(1688年)分别改山角驿、山枣驿为巡检司。
康熙二十八年(1689年)，全州知州黄志璋修《全州志》共8卷、8纲、63目。今存。
康熙二十九年(1690年)十二月大雪，竹木尽凋。
康熙三十四年(1695年)正月，全州地震。
康熙三十六年(1697年)春夏大饥，清廷诏免全州当年田赋。
康熙三十七年(1698年)，全州大饥，民掘金羊头等野生植物充饥。
康熙四十八年(1709年)在州城西坡(今县城建设街西段)重建凤坡书院。
康熙五十二年(1713年)二月二十七晚，大风、雨、雹自北入境。屋瓦皆飞，大树拔，北城女墙尽毁，湘山寺妙明塔顶堕地。
同年五月十一日，大水，城内水深7尺，6日方退。六月大旱，民大饥，斗米银6钱。
康熙五十四年(1715年)三月。康熙帝为湘山寺题“寿世慈荫”四字，刻于笋布台石崖上，面积18.57平方米。
康熙五十五年(1716年)盐昂贵，州民十之八九淡食。
康熙年间，全州有集市宜湘圩等8处。
雍正二年(1724年)自七月至十二月不雨，井泉多涸。
雍正四年(1726年)知州张林重修城垣，高2.5丈，阔1.5丈，周5里3分，垛口959个。
雍正六年(1728年)五至八月大旱，早禾无收，迟禾半熟。
乾隆七年(1742年)五月大旱，清廷诏免次年田赋。
乾隆十三年(1748年)四月至次年三月，疫病遍及城乡。山中草药挖尽。
同年，有虎患，常深夜入村吞食人畜，万乡(今大西江、龙水乡)尤甚。
同年六月，民大饥。
乾隆二十一年(1756年)，翰林院编修蒋良骐回籍与谢廷瑜合修《全州志》。
乾隆五十一年(1786年)白塘村赵光轩等扩建清湘书院。
乾隆五十九年(1794年)五月十九日大水，城内水深丈余，一昼夜方退。
嘉庆二年(1797年)州守温之诚倡议重建距城北三里之龙山“镇湘塔”。
嘉庆四年(1799年)知州温之诚续纂《全州志》，全书十三卷。今存复印本。
嘉庆二十一年(1816年)邑人集资刊刻明代名臣蒋冕所著《湘皋集》。
道光元年(1821年)开采东山七宝坑铅锌矿。
道光二十六年(1846年)州属西延分州油榨坪创办桂剧“秀”字科班，为广西最早的桂剧科班。
道光二十七年(1847年)九月，湖南新宁瑶民雷再浩联络全州李世德、肖立山组织武装起义，攻占全州西延梅溪口、大埠头、咸水口等地，后被清廷镇压而失败。
同年，各乡、都奉清廷令办团练，抵御农民起义军。
咸丰二年(1852年)四月，太平天国攻克全州城，全歼清军及州署官吏，旋与清军江忠源部战于蓑衣渡。南王冯云山殉难。
咸丰四年(1854年)八月，升平军(亦称红巾军)邓正高部自灌阳入境，与全州知州苏凤文大战于沛田。
同年十一月邓正高部进攻全州城，未克。
咸丰五年(1855年)六月，邓正高率领数千人自东安退入升乡，向苏凤文投降，所部编入全州城勇。
咸丰六年(1856年)六月，全州会党首领蒋帮大、马十六等在大腊口准备起义，事泄，被苏凤文捕杀。
同年十月，建乡江南村陈永秀率升平军自灌阳入全，在鲁荐山中击毙山枣司巡检黄师宗和团练黄建极。
咸丰七年(1857年)正月，升平军主将黄金亮(全州人)率部围攻全州城，不克。
同治十年(1871年)安南贡使解送两只大象经全州，沿途观者甚众。
光绪十四年(1888年)七月，白宝一带，蝗虫铺天盖地自北而来，啮食田禾，其声入夜可闻。
光绪十六年(1890年)英国基督教徒裴乐义来全州城设福音堂，办学校。
光绪二十一年(1895年)民间创办“南”字科班，培养桂剧艺人。
光绪二十二年(1896年)知州洪杰饬令县城商民捐谷设义仓，积谷千石以上，以备荒赈灾。
光绪二十三年(1897年)，全州哥弟会首领王名卿、胡栋廷举行反清起义，五月二十一日，
集会党2000余人，攻破灌阳县城，二十五日，转入内建乡，欲攻兴安，在四所村被团练围攻，阵亡200人而失败。
光绪二十八年(1902年)全州大疫，五月至九月，人死万余，出现死人无人埋，禾熟无人收的惨象。
同年在州城始设邮政代办所。
光绪三十二年(1906年)邑人赵炳麟、蒋任衡、唐鹤在宾兴局(今县府大院内)创办州立两等小学堂，并附设师范讲习所一班(一年制).
同年，全州设立电报局。
光绪三十四年(1908年)英人班为兰在全州城设点传教，民众群起反对，后被清廷宣旨压服。
宣统元年(1909年)知州周岸登创设全州公田局，并设捐务处，征收田赋，管理屠、秤两捐。
宣统二年(1910年)成立全州商会.
宣统三年(1911年)十一月，知州陈崇澧偕同盟会会员刘仲森在湘山寺召开群众大会，宣布响应广西独立