1、不宜浸种催芽因为种衣剂溶于水后，不但会使种衣剂失效，而且溶水后的种衣剂还会对种子的萌发产生抑制作用。
2、不宜常规试芽测芽 因为包衣种子的试芽、测芽试验非常复杂，技术要求较高，并且不易掌握，常规测芽方法不但发不出芽，而且还会使种子丧失使用价值，甚至发生药剂中毒事故。所以，使用包衣种子，可不必进行试芽、测芽试验。、直接使用即可。
3、包衣种子播后不宜立即施用敌稗类除草剂 如先播种，需30天后再用敌稗；如先用敌稗，要在3天后播种。
4、不宜用于盐碱地 因为种衣剂遇碱即会失效。所以在pH值大于8的地块上不宜使用包衣种子。
5、不宜用于地低洼易涝地 因为包衣种子在地下水位高的土壤环境条件下使用，极易造成包衣种子酸败腐烂。